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本文標題："微生物中獲取出來-已知的微生物分析顯微鏡"
新聞來源：未知 發(fā)布時間：2018-5-9 17:15:10 本站主頁地址：http://m.vndmy.cn
微生物中獲取出來-已知的微生物分析顯微鏡
位素微陣列中，放射性標記RNA(特別包括14C)從樣本中提取出來并
進行熒光子標記，然后靶向識別相應(yīng)的不同微生物的16S rRNA。在這種
方法中，可以攝取標記的生物可以被快速分離，不用事先了解共有的成
分(Adamczyk等，2003)。同位素微陣列是一種高通量篩選方法可以縮短
孵育時間。但是與SIP不同，同位素微陣列只能檢測序列已知的微生物
，因此考慮到這點，它的限制性更強。像先前討論中提到FISH—MAR技
術(shù)的限制是生物代謝靜止(或簡單慢速生長)的時候樣本將會消失，而且
這項技術(shù)對放射標記的基質(zhì)研究也同樣受到限制。 基因組組合技術(shù)
雖然同位素標記能將特殊代謝能力和環(huán)境中的特殊微生物聯(lián)系起來
，但不能了解它是整個代謝中的哪個環(huán)節(jié)。這些問題，可以用基因組推
斷潛在的代謝能力或催化地質(zhì)化學(xué)反應(yīng)的能力來擬補。強調(diào)它是潛在的
，對基因組研究再好不過了，因為它能夠暗示目標生物可能進行的代謝
。這種分析(經(jīng)常稱為代謝組學(xué)；Risesenfeld等，2004；DeLong，2007
)依賴繁瑣的計算分析來比較每個不同序列，從而鑒定DNA基序或預(yù)測基
因產(chǎn)物的特殊功能。還可以推測相關(guān)一種已知蛋白可能催化的反應(yīng)，或
在哪種基因的編碼情況下它能夠表達；有時，基因組分析甚至能應(yīng)用于
整個微生物群落的活動中(Tyson等，2004；DeLong等，2006)。最終，
這些假設(shè)可能通過經(jīng)典基因檢測和生化分析來證明特殊基因的存在，推
斷的代謝或地質(zhì)化學(xué)作用(見8．4部分和Martinez等，2007)。多種方法
能夠?qū)⒒蚪M信息從特殊環(huán)境的微生物中獲取出來(例如，磁電機一FIS
H，數(shù)字PCR)。因此即使細胞宿主已經(jīng)丟失，如果有足夠量DNA能克隆到
重裝的整個基因組中，宏基因組學(xué)仍可以特定生物體獲得。我們強調(diào)假
設(shè)，因為從環(huán)境DNA重建最初的基因組依舊具有很大挑戰(zhàn)性。不僅是基
因的表達原位監(jiān)測(Ram等，2005)，而且可以追蹤到自然環(huán)境中特定基
因型和它們關(guān)系較近的種群(Rich等，2008)以指導(dǎo)培養(yǎng)基的設(shè)計來分離
／研究特殊地質(zhì)微生物(Tysom等，2005；Sabehi等，2005)。關(guān)于地質(zhì)
微生物在地質(zhì)微觀背景中基因組學(xué)面臨的問題、機遇和挑戰(zhàn)更全面的討
論見Banfield等(2005)。8．3．5代謝基因的表達或它們基因產(chǎn)物的探
針檢測
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