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本文標(biāo)題："生物物種水平分化通常相似為97％-微生物鑒定"
新聞來源：未知 發(fā)布時(shí)間：2018-5-3 16:39:22 本站主頁地址：http://m.vndmy.cn
生物物種水平分化通常相似為97％-微生物鑒定
非培養(yǎng)的生物學(xué)方法
雖然最初廣泛應(yīng)用非培養(yǎng)的磷脂脂肪酸法(PLFA)來分析環(huán)境中的菌
群類型，但如今DNA和RNA測序方法更加廣泛地應(yīng)用于微生物鑒定和它們
的系統(tǒng)發(fā)育樹研究。這些方法已經(jīng)用于定位和定量分析分離出的環(huán)境中
的微生物，甚至是那些能夠在環(huán)境中增殖但未被實(shí)驗(yàn)室分離培養(yǎng)的微生
物。
微生物的16S rRNA序列不僅具有高度保守的核苷酸序列，而且序列
的多樣性提供了區(qū)分細(xì)菌、古菌和真核生物之間差異的方法。基于上述
多樣性的水平、系統(tǒng)發(fā)育、基因組和物種水平上也會(huì)有差別(Ward等，1
992)。實(shí)際上，生物物種水平的分化通常相似性為97％；這是整個(gè)基因
組DNA—DNA雜交結(jié)果與16S rRNA序列相近呈現(xiàn)弱相關(guān)性的基礎(chǔ)(Stackeb
randt和Goebel，1994)。在整個(gè)基因組的雜交中，16S rRNA序列大于70
％而小于97％的鏈相近即被認(rèn)為是同種屬的一部分。由于任何新生物的
16S rRNA序列一旦發(fā)現(xiàn)就會(huì)進(jìn)入數(shù)據(jù)庫，可以將新分離到的16S rRNA序
列在數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行比較來確定是否已被精確報(bào)道，并鑒定親緣關(guān)系。雖
然16S rRNA序列已被證明為可靠的系統(tǒng)發(fā)育標(biāo)記，但還是推薦讀者了解
一下Olsen和Woese寫的關(guān)于高分子對(duì)比系統(tǒng)發(fā)育重要性的綜述，既可作
為檢測分子系統(tǒng)發(fā)育總的可靠性方法，也可作為更廣泛基因組發(fā)育史的
方
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